植物病害 ，特別是由真菌病原體引起的疾病 ，危害全球作物生物安全和預防它們需要快速檢測和鑒定病原體 。用於作物疾病診斷的傳統方法依賴於可以通過眼睛識別疾病的病理學家的專業知識 ，但是這種方法具有許多限製 ，包括依賴於疾病症狀的外觀 。

還值得注意的是 ，這種傳統方法不允許在爆發期間快速識別未知病原體 。這種限製最近在孟加拉國變得明顯 ，當時小麥作物被南美種族的小麥爆炸真菌侵入而遭受破壞 。

由於小麥是世界上最重要的作物之一 ，一群澳大利亞科學家希望通過開發一種分析小麥葉片樣品中病原體DNA的新方法來解決這一局限 。使用便攜式DNA測序儀 ，他們能夠實現小麥中病原體的早期和廣泛檢測 - 他們還能夠表征小麥中的所有生物 ，並確認存在未被病理學家診斷出的意外疾病 。

據該研究背後的科學家稱 ，“現場和集中測序方法的結合將在未來徹底改變農業生物安全管理 ，減少作物損失 。” 此外 ，這些方法可以納入國家邊境的常規野外疾病監測和生物安全監測 ，以節省時間和金錢 ，並防止像孟加拉國那樣的另一次災難性爆發 。

在開放獲取文章“使用便攜式DNA測序儀對感染小麥進行病原體檢測和微生物組分析”中討論的這項研究也探討了這種新策略可以識別疾病抑製微生物用於環境友好控製疾病的方式 。該研究於2019年5月在線完成 ，最終發表於6月份的完全開放獲取Phytobiomes期刊 。